Az Assassin’s Creed Rogue Remastered egy új főhőst állít a középpontba, így egy egykori Orgyilkosból lett Templomos, bizonyos Shay Patrick Cormac történetét ismerhetjük meg általa. Ebben az epizódban így végre felfedezhetjük a sorozatban mindvégig ellenségként kezelt másik frakció sajátosságait is, ám mivel a főszereplő egykoron a jó oldalon szolgált, ez a játékmenetre semmilyen hatással sem lesz. Ebből kifolyólag továbbra is a szélvészgyors, csendes harcmodort részesíthetjük előnyben, de a lopakodás, a hallgatózás és a hatalmas épületek megmászása sem okoz majd problémát Shay számára.

Az Assassin’s Creed Rogue Remastered-ben egyébiránt visszatérünk Észak-Amerikába, ahol olyan új területeket fedezhetünk fel magunknak, mint az észak-atlanti partvidék, az Appalache-folyó völgye vagy New York áttervezett és átszabott városa. A kampány természetesen ezúttal is egy nagyobb történelmi korszakban, a 18. századi hétéves háború idején játszódik, ami 1754-től egészen 1763-ig tartott. A cselekmény éppen ezért ezer szállal kötődik majd a harmadik és a negyedik epizódhoz, azon belül is az ott megismert Kenway családhoz, amelynek tagjairól nagy valószínűséggel újabb rejtélyeket és sötét titkokat is megtudhatunk.