A cselekmény valós események kitalált történetében játszódik , és a béke és a szabad akarat megőrzéséért küzdő Asszaszinok és a templomosok közötti, évezredek óta tartó harcot követi nyomon , akik az irányítás révén békére vágynak. A keretes történet a 21. században játszódik, és a sorozat főszereplőjét, Desmond Milest mutatja be , aki az Animus néven ismert gép segítségével újraéli ősei emlékeit, hogy megtalálja a módját a 2012-es apokalipszis elhárításának . A fő elbeszélés a 18. századi gyarmati Amerikában játszódik 1754 és 1783 között, és két karaktert követ, akiknek történetei összefüggenek: Haytham Kenway brit templomos, aki megpróbálja kiépíteni rendjének jelenlétét a gyarmatokon a francia és az indiai háború idején ; és Ratonhnhaké:ton / Connor , Haytham félig mohawk fia, aki bérgyilkos lesz, hogy megvédje népe földjét és megbosszulja anyja halálát, és harcol a templomosok azon kísérletei ellen, hogy befolyásolják az amerikai forradalom kimenetelét .