Ezen epizódban egy Assassinból lett Templomos felett vehetjük majd át az irányítást, és az Assassin's Creed játékok esetében először lehetünk részesei egy olyan kalandnak, ahol egy templomos a főhős. Shay Patrick Cormack egy tragikus esemény következményeképpen bosszút esküszik tanítói, az Assasinok ellen, és megfogadja, hogy egyesével likvidálja a bérgyilkos rend tagjait. Ezen küldetése azonban csöppet sem bizonyul majd egyszerűnek, hiszen a testvériség tagjai mind megfelelő kiképzésben részesült harcosok, akikkel nem lesz olyan könnyű elbánnunk. Az Assassin's Creed Rogue-ban teljes mértékben kihasználhatjuk majd a Templosomok fegyvereit, és egyéb kiegészítőit, így egy minőségi arzenállal vadászhatunk ellenségeinkre. Mind a lopakodást, mind pedig az akciót kedvelő játékosok megtalálják majd a számításaikat ezen epizód keretein belül, hiszen nemcsak a főszereplő mozgáskultúrája, de fegyverzete is lehetővé teszi majd, hogy több módon is végezhessünk ellenfeleinkkel. A korábbi epizódokban szereplő hajózás lehetősége is visszatért: fejleszd fel lehetőségeid szerint a hajódat, gyűjts legénységet és légy te a tengerek ura!