A visszavonult ügynök, Sam Fisher visszatért. De ilyen ellenséggel még sosem állt szemben. Egy pusztító terrortámadás megakadályozása érdekében be kell épülnie egy veszélyes terroristacsoportba, és belülről kell elpusztítania azt. Most először kap ízelítőt a kettős ügynöki élet állandó feszültségéből és nehezen emészthető dilemmáiból. Miközben beszivárogsz egy terrorista szervezet amerikai központjába, gondosan mérlegelned kell tetteid következményeit, nehogy elveszítsd az egyik vagy a másik oldal bizalmát.