A játék követi a Rabbids-t, akik azt tervezik, hogy uralják a felszínt népességük növelésével. A vezető azt akarja, hogy a tudós nyúl egy tehenet használjon a több nyulak tenyésztésére irányuló kísérletükhöz. Amint sikerült, megkezdődik az invázió, és a játékosnak sok minijátékot kell teljesítenie, hogy visszatartsa a nyulakat, mielőtt túl késő lenne.